Plataforma LAMP para Diagnóstico Rápido de T. gondii e Giardia spp.

Desenvolvimento e validação de um sistema portátil baseado na técnica LAMP alinhado à abordagem One Health

DNA Helix

Introdução

Toxoplasma gondii

Toxoplasma gondii é um protozoário parasita intracelular obrigatório que infecta aproximadamente um terço da população humana mundial (Dubey, 2010). A infecção pode causar toxoplasmose congênita em gestantes e doença grave em imunocomprometidos.

Giardia spp.

Giardia duodenalis é um protozoário flagelado que causa giardíase, uma das principais doenças diarreicas em humanos e animais (Ryan & Cacciò, 2013). A transmissão ocorre via água ou alimentos contaminados, com impacto significativo na saúde pública.

One Health e ODS

A abordagem One Health reconhece a interconexão entre saúde humana, animal e ambiental. Este projeto se alinha diretamente com os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) 3 (Saúde e Bem-estar), 9 (Indústria, Inovação e Infraestrutura) e 17 (Parcerias para os Objetivos).

ODS 3 ODS 9 ODS 17

Justificativa

Limitações Diagnósticas

Os métodos atuais (microscopia, ELISA) apresentam baixa sensibilidade. O qPCR, apesar de sensível, requer equipamentos caros e mão de obra especializada, inviabilizando seu uso em campo.

Vantagens da LAMP

A técnica LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification) permite amplificação isotérmica rápida (60 min) com alta sensibilidade e especificidade, dispensando termocicladores (Notomi et al., 2000).

Portabilidade

A adaptação da LAMP para um dispositivo portátil permitirá diagnóstico em tempo real em situações de campo, unidades básicas de saúde e vigilância ambiental, democratizando o acesso a diagnóstico molecular.

Objetivos

Objetivo Geral

Desenvolver e validar uma plataforma de diagnóstico molecular portátil baseada na técnica LAMP para detecção simultânea de T. gondii e Giardia spp., alinhada aos princípios One Health.

Objetivos Específicos

  • Selecionar e otimizar primers para os alvos REP-529 (T. gondii) e GDH (Giardia spp.)
  • Desenvolver protocolos LAMP multiplex
  • Validar frente ao qPCR padrão-ouro
  • Adaptar para dispositivo portátil com detecção colorimétrica

Metodologia

Desenho de Primers In Silico

Alvo REP-529 (T. gondii)

O elemento repetitivo REP-529 (529 bp) foi selecionado por apresentar 200-300 cópias no genoma de T. gondii, garantindo alta sensibilidade (Homan et al., 2000).

F3: 5'-GGA AGG CAA GTC TGG AGA AG-3'
B3: 5'-TGC ATC TGT AGG TCG AAC ATC-3'
FIP: 5'-TCC GCT GCA GAC ACA GTA TTC GGA GGG GAC GAA TTT CGT C-3'
BIP: 5'-AGC TTC CCT CGA ATG CAG TTC TTT TTG CGT TCA AAG CGT TCG-3'
LF: 5'-GCA GTA TCG TCG TGT GGT TC-3'
LB: 5'-CGC TTC TCG TTG TTG CTC TC-3'

Alvo GDH (Giardia spp.)

O gene da enzima glutamato desidrogenase (GDH) foi selecionado por sua conservação entre isolados de Giardia e diferenciação de assemblages (Amar et al., 2002).

F3: 5'-GCA CGG ACG TTC CAG ACT-3'
B3: 5'-GCC TCG TCC ATC GCA A-3'
FIP: 5'-TCC TGG AGG AAG GAG CGA GAA GGT TTG GGT TCA TCG AAC C-3'
BIP: 5'-GGC TTC CGC TTC ATC GAC GTT TTT CAA CGT TCA CCG ACG AC-3'
LF: 5'-GAG CGA GGT GGA AAC ACC AA-3'
LB: 5'-GAC GAC CTC ACG GCA AAG TT-3'

Os primers foram desenhados utilizando o software PrimerExplorer V5 (Eiken Chemical) e avaliados quanto a formação de estruturas secundárias (ΔG < -5 kcal/mol) e especificidade por BLASTn contra o banco de dados NCBI.

Fluxograma Metodológico

Análise In Silico

Otimização In Vitro

Amostras Clínicas

Validação

Dispositivo Portátil

Reação LAMP

  • Volume total: 25 μL
  • Temperatura: 65°C
  • Tempo: 60 min
  • Indicador: HNB (azul→violeta)

Extração de DNA

  • Kit comercial (QIAamp)
  • Protocolo rápido (10 min)
  • Controle: C. parvum

Validação

  • Sensibilidade: Limite de detecção
  • Especificidade: 100 isolados
  • Comparação: qPCR TaqMan

Dispositivo Portátil

Especificações Técnicas

  • Bateria recarregável (8h autonomia)
  • Bloco térmico preciso (±0.5°C)
  • Detecção colorimétrica por smartphone
  • Peso: <300g, dimensões: 12x8x4cm
Dispositivo Portátil

Resultados Esperados

Desempenho Técnico

Sensibilidade

>95% comparado ao qPCR

Especificidade

>98% sem reação cruzada

Limite de Detecção

1-10 cópias/μL

Impacto Esperado

Redução de custos diagnósticos em até 70% comparado a qPCR, permitindo implementação em unidades básicas de saúde

Capacitação de profissionais para diagnóstico molecular em regiões remotas

Implementação Arduino

Circuito do Dispositivo LAMP

Componentes Principais:

  • Arduino Nano (controle principal)
  • Módulo Peltier (controle térmico)
  • Sensor DS18B20 (monitoramento de temperatura)
  • Módulo Bluetooth HC-05 (conexão com smartphone)
  • LED RGB (indicação visual dos resultados)

Código Principal

#include <OneWire.h>
#include <DallasTemperature.h>

#define ONE_WIRE_BUS 2
OneWire oneWire(ONE_WIRE_BUS);
DallasTemperature sensors(&oneWire);

const int peltierPin = 3;
const int ledPin = 4;
float targetTemp = 65.0;

void setup() {
  Serial.begin(9600);
  sensors.begin();
  pinMode(peltierPin, OUTPUT);
  pinMode(ledPin, OUTPUT);
}

void loop() {
  sensors.requestTemperatures();
  float currentTemp = sensors.getTempCByIndex(0);
  
  // Controle PID simplificado
  if(currentTemp < targetTemp - 0.5) {
    digitalWrite(peltierPin, HIGH);
  } else if(currentTemp > targetTemp + 0.5) {
    digitalWrite(peltierPin, LOW);
  }

  // Monitoramento serial
  Serial.print("Temperature: ");
  Serial.print(currentTemp);
  Serial.println(" °C");
  
  delay(1000);
}

Fluxo de Operação

1. Ligar dispositivo

2. Aquecer a 65°C

3. Inserir amostra

4. Ler resultados

Desenho Industrial e Montagem

Especificações do Design

  • Dimensões: 120mm x 80mm x 40mm
  • Carcaça em ABS impressa em 3D
  • Compartimento térmico isolado
  • Janela transparente para observação
Design 3D

Diagrama de Montagem

Diagrama de Circuito

Passo a Passo de Montagem

1
Preparação da Carcaça

Imprima as peças em 3D usando ABS. Lixe as rebarbas e encaixe as partes para verificar o ajuste.

2
Instalação do Sistema Térmico

Cole o módulo Peltier no bloco de alumínio usando pasta térmica. Instale o sensor DS18B20 próximo ao centro.

3
Montagem da Placa

Soldar todos os componentes na protoboard conforme diagrama. Conectar o Arduino Nano, módulo Bluetooth e LED RGB.

4
Integração Final

Fixar a placa na carcaça inferior. Conectar os fios do Peltier e sensor. Ajustar a janela transparente.

5
Testes Finais

Ligar o dispositivo e verificar: controle de temperatura, comunicação Bluetooth e indicação LED.

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